Молекулярное моделирование механизмов реакций нуклеофильного присоединения остатков цистеина белков к органическим молекулам - Диссертации

Молекулярное моделирование механизмов реакций нуклеофильного присоединения остатков цистеина белков к органическим молекулам Диссертации

Общие сведения

Соискатель

Кулакова Анна Михайловна

Статус защиты

Защищена

Ученая степень

Кандидат физико-математических наук по специальности 02.00.15 - Кинетика и катализ

Дата защиты

3 дек. 2019 г.

Дисс. совет

МГУ.02.08 - Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова

Руководители

Хренова Мария Григорьевна - Доктор физико-математических наук
Научный руководитель

Оппоненты

Коваленко Илья Борисович - Доктор физико-математических наук
Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова

Полежаев Андрей Александрович - Доктор физико-математических наук
Физический институт им. П. Н. Лебедева РАН

Свитанько Игорь Валентинович - Доктор химических наук
Институт органической химии им. Н. Д. Зелинского РАН

Организация выполнения работы

Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова

Статьи (4)

1	Khrenova M.G. , Kulakova A.M. , Nemukhin A.V. Competition between two cysteines in covalent binding of biliverdin to phytochrome domains Organic & Biomolecular Chemistry. 2018. V.16. N40. P.7518-7529. DOI: 10.1039/c8ob02262c Scopus OpenAlex
2	Кулакова А.М. , Хренова М.Г. , Немухин А.В. Моделирование спектров мутантных форм красных флуоресцентных белков Вестник Московского Университета. Серия 2: Химия. 2018. Т.59. №5. С.332–336. РИНЦ
3	Kulakova A. , Lushchekina S. , Grigorenko B. , Nemukhin A. Modeling reactivation of the phosphorylated human butyrylcholinesterase by QM(DFTB)/MM calculations Journal of Theoretical and Computational Chemistry. 2015. V.14. N07. 1550051 . DOI: 10.1142/s0219633615500510 Scopus OpenAlex
4	Немухин А.В. , Кулакова А.М. , Лущекина С.В. , Ермилов А.Ю. , Варфоломеев С.Д. Моделирование химических превращений в активных центрах холинэстераз методами квантовой теории Вестник Московского Университета. Серия 2: Химия. 2015. Т.56. №6. С.343–347.

Тезисы (7)

1	Кулакова А.М. , Григоренко Б.Л. , Миронов В.А. , Хренова М.Г. Молекулярное моделирование ковалентного связывания биливердина в белке miRFP670 В сборнике Физическая химия в России и за рубежом: от квантовой химии до эксперимента : I Конференция с международным участием, Черноголовка,17-19 июня 2019 : Книга тезисов. 2019. – C.24–25.
2	Кулакова А.М. Молекулярное моделирование взаимодействия фермента KRASG12C с соединением ARS-853 В сборнике Ломоносов-2019, секция "Химия": материалы XXVI Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных, Москва, 8-12 апреля 2019 г.. – Перо., 2019. – C.806. – ISBN 9785001501237.
3	Кулакова А.М. , Хренова М.Г. , Немухин А.В. Молекулярное моделирование кинетики ковалентного связывания ARS-853 с ферментом KRASG12C В сборнике XXXVI Всероссийский симпозиум молодых ученых по химической кинетике : Сборник трудов. – Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова, Химический факультет., 2019. – C.55. – ISBN 978-5-91556-506-6.
4	Кулакова А.М. , Хренова М.Г. , Немухин А.В. Молекулярное моделирование механизма взаимодействия белка KRASG12C с 21 соединениями ARS-853 и ARS-1620 В сборнике 26 Международная Конференция "Математика. Компьютер. Образование". 2019. – C.46.
5	Кулакова А.М. , Хренова М.Г. , Немухин А.В. Использование метода DFTB для исследования структуры красных флуоресцентных белков mKeima и eqFP670 В сборнике Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул : Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod-2018 (Новосибирск, 28–30 апреля 2018 г.). – ИПЦ НГУ., 2018. – C.28–29. – ISBN 978-5-4437-0805-8.
6	Кулакова А.М. , Хренова М.Г. , Немухин А.В. Ковалентные ингибиторы белка RAS В сборнике Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул : Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod-2018 (Новосибирск, 28–30 апреля 2018 г.). – ИПЦ НГУ., 2018. – C.26–27. – ISBN 978-5-4437-0805-8.
7	Кулакова А.М. , Хренова М.Г. , Немухин А.В. Молекулярное моделирование механизма ингибирования белка K-Ras-G12C прототипным соединением ARS-853 В сборнике Математика. Компьютер. Образование : Тезисы XXV международной конференции. 2018. – C.71.

Конференции (10)

1	Физическая химия в России и за рубежом: от квантовой химии до эксперимента : I конференция с международным участием 17-19 июн. 2019, Черноголовка
2	Ломоносов-2019 : XXVI Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных 08-12 апр. 2019, Москва
3	XXXVI Всероссийский симпозиум молодых ученых по химической кинетике 18-21 мар. 2019, Мытищи
4	Математика. Компьютер. Образование : XXVI международная конференция 28 янв. - 2 февр. 2019, Пущино
5	Биохимическая физика : XVIII Ежегодная молодежная конференция c международным участием ИБХФ РАН - ВУЗы 14-15 нояб. 2018, Москва
6	Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул : Вторая Школа молодых ученых 28-30 апр. 2018, Новосибирск
7	XXV Международная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов» 09-13 апр. 2018, Москва
8	Математика. Компьютер. Образование : XXV международная конференция 29 янв. - 3 февр. 2018, Дубна
9	Биохимическая физика : XV Ежегодная международная молодежная конференция ИБХФ РАН - ВУЗы 23-25 нояб. 2015, Москва
10	Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Ломоносов» 13-17 апр. 2015, Москва